Henrique Horta jest absolwentem lizbońskiego Uniwersytetu ISCTE-IUL. Posiada tytuł magistra stosunków międzynarodowych, a jego praca dyplomowa dotyczyła przystąpienia Ukrainy do UE. Po zdobyciu wiedzy z zakresu demografii, nauk politycznych i historii w trakcie studiów, jest ekspertem w dziedzinie nauk o populacji. Henrique Horta mówi również po portugalsku, hiszpańsku, francusku i angielsku.